LocalでMPIを使ったMD計算をしたい

Windows版　検証環境

検証日

2016/11/08

OS

Windows10

MS MPI Version

7.1.12327.25

Windows版　MS MPIのインストールと実行

1. 下記でMS MPIのMSMpiSetup.exeをダウンロードします。

   https://www.microsoft.com/en-us/download/details.aspx?id=52981

2. ダウンロードしたインストーラをダブルクリックして実行します。

   

   以下はインストーラ起動後の図です。インストールの設定はデフォルトのままで問題ありません。

   

3. MF myPrestoで、水付加/イオン付加/トポロジーファイル作成が済んだデータを用意します。

4. MF myPrestoの[MD]のタブで[Min]/[MD]いずれかのボタンをクリックします。

5. 開いたダイアログで[プロセス]のタブを開きます。

6. プロセスの種類で[Cosgene ロカールPC]を選びます。

7. [MPIを使う]をチェックします。

8. [プロセス数]に並列数を入力し、[MPIバイナリーディレクトリーパス]にMS MPIをインストールしたフォルダにあるBinフォルダのパスを設定します。

   

   並列計算しているかどうかはWindowsのタスクマネージャーから確認できます。下図赤枠は4並列でMDのプログラム(cosgene_MPI)を起動した例です。