設定可能な番号の確認
チェイン先頭番号またはチェイン最終番号のボックスの上にマウスカーソルを合わせると、設定可能な分子鎖番号とそれに対応する分子鎖名が表示されます。
残基先頭番号または残基最終番号のボックスの上にマウスカーソルを合わせると、現在設定されている分子鎖番号に対応した分子鎖名と、その分子鎖で設定可能な残基番号の範囲が表示されます。
上記の例では、チェイン先頭/最終番号1が“pro”(タンパク質)、番号2-2224は“tip3p_water”(水分子)。番号2225-2236はCl/Na(カウンターイオン)をあらわしています。
拘束条件を、
とした場合、
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タンパク質分子のCα原子 |
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6つあるCl-イオンのうち一番初めのイオン原子 |
が拘束されることになります。
