位置拘束設定


位置拘束の設定は、各ジョブの“拘束条件”の[位置拘束の設定]ボタンからおこないます。

 

 

ボタンをクリックすると設定のためのダイアログが開きます。

 

 

拘束条件は複数追加できます。新しい条件を追加する場合は、[追加]ボタンをクリックします。

 

1つの拘束条件で設定可能なパラメータは以下のとおりです。

 

パラメータ

説明

チェイン先頭番号

位置拘束の始まりとする分子鎖番号です。

 

チェイン最終番号

位置拘束の終わりとする分子鎖番号です。

 

残基先頭番号

位置拘束の始まりとする残基番号です。

 

残基最終番号

位置拘束の終わりとする残基番号です。

 

原子名

位置拘束させる原子名です。

アスタリスクはワイルドカードを意味し、“C*”とした場合はすべての炭素原子が拘束の対象となります。

 

残基名

位置拘束させる残基名です。

アスタリスクはワイルドカードを意味し、​“A*”​とした場合は、タンパク質分子の場合、​“ALA”、​“ARG”、​“ASN”、​“ASP”​が拘束の対象となります。

 



 設定例
 マウス操作での拘束設定


 Cosgene MD 計算