グリッドポテンシャルの生成

前節で指定した受容体ポケット領域周辺にグリッドポテンシャルを生成します。

手順は以下のとおりです。

１．リボンの［ドッキング］タブの［グリッドポテンシャルの作成］ボタンをクリックします。なお、ツリービューで［Sievgene pocket］を右クリックし、［グリッドポテンシャルの作成］のメニュー項目で同操作を行えます。

➜　［Sievgeneグリッドポテンシャルの作成］ダイアログが表示されます。

２．グリッドポテンシャル生成のための設定をおこない［実行］ボタンをクリックします。

➜　バックグラウンドでsievgeneが起動し、グリッドポテンシャル生成の処理が開始されます。処理中の内容は、メッセージウィンドウに出力されます。途中で処理を中断したい場合は、［中断］ボタンをクリックしてください。

　設定の詳細については「設定」を参照してください。

処理が終わるとグリッドポテンシャルが受容体ポケット周辺に表示されます。

以下のA.S.A.ポテンシャル界面は、プロトン原子をプローブとして分子表面を転がしたときのA.S.A.ポテンシャルで、値1.0の等値面です。色づけは、各頂点での静電ポテンシャル値を使って、最小値（マイナス側）を赤、最大値（プラス側）を青、中間を白で色づけしています。

リボンの［ドッキング］タブの［ドッキングシミュレーション］ボタンが有効になります。