4.3. 残基編集

概要

この項ではPDBのデータのエラーなどを検出し、残基を編集する操作手順を説明します。

残基編集の機能では下記の項目の検出と編集が行えます。

残基編集のタブ	説明
AltLocの選択	Alternate location indicator(1残基に複数構造あるもの)の検出と構造の選択
主査原子欠損の補正	主鎖原子の欠損の検出と原子が欠損した残基の削除
保護基の付加	末端残基の検出と保護基の追加、分子鎖の接続
SSBOND行の追加	SSBONDの検出と追加
CYS->CYM	金属配位のCYS(システイン)の検出と加工
近接原子の補正	近接している原子の検出と補正
二面角の補正	直行している二面角の検出と補正

操作手順は下記のとおりです。

1. [残基編集]ボタンをクリックします。

   図1:[残基編集]のクリック

   

2. [更新]ボタンをクリックし、対象の分子から該当する箇所を検索します。

   図2:[更新]のクリック

   
3. ダイアログ右のチェックボックスやボタンでデータを修正します。

   [強調表示]をチェックすると、選択箇所をシーンウィンドウで黄色くハイライトします。

   図3:チェックボックスのクリックによるデータの編集

   

   Note

   保護基を付けた時や残基名を変更した時は編集後 [Hを生やす]を実行します。