出力設定

 

MD計算の出力に関する設定をおこないます。

 

リスタートファイル出力をするMDステップ回数

OUTRSL

 

 

リスタートファイルを出力するためのステップ数を設定します。

リスタートを実行した際には、最後に出力されたリスタートファイルが使用されます。

 

 MD計算実行中、この設定により出力されるリスタートファイルを定期的に読み込んでシーンウィンドウ上に表示されている分子データの座標を更新しています。座標変化を細かく確認したい場合は、この設定を小さい値に設定してください。ただし、作業ディレクトリーには、小さく設定したぶんだけ多くのリスタートファイルが出力されます。

 

MDエネルギートラジェクトリーファイル形式

MNTREN

 

 

MDエネルギートラジェクトリーファイルの出力形式を以下から選択します。


出力しない                                                      NO                      

 

  MDエネルギートラジェクトリーファイルを出力しません。

 

ASCII形式                                                     ASCI                   

 

  MDエネルギートラジェクトリーファイルをアスキー形式で出力します。後述の倍精度形式

  に比べてファイルサイズが大きくなります。

  以下の追加設定が必要です。

 

出力のタイミング

OUTENE

 

 

MDエネルギートラジェクトリーの出力のタイミングを設定します。100と設定した場合、100ステップ毎にそのときのエネルギートラジェクトリーが出力されます。

 

 

倍精度バイナリ形式                                        DOUB                 

 

  MDエネルギートラジェクトリーファイルを倍精度バイナリ形式で出力します。

  以下の追加設定が必要です。

 

出力のタイミング

OUTENE

 

前述と同じです。

 

 

 

座標トラジェクトリーファイル形式

MNTRCO

 

 

座標トラジェクトリーファイルの出力形式を以下から選択します。


出力しない                                                      NO                      

 

  座標トラジェクトリーファイルを出力しません。

 

ASCII形式                                                     ASCI                   

 

  座標トラジェクトリーファイルをアスキー形式で出力します。後述の倍精度形式に比べてフ

  ァイルサイズが大きくなります。

  以下の追加設定が必要です。

 

出力のタイミング

OUTCOO

 

 

座標トラジェクトリーの出力のタイミングを設定します。100と設定した場合、100ステップ毎にそのときの座標が出力されます。

 

 

倍精度バイナリ形式                                        DOUB                 

 

  座標トラジェクトリーファイルを倍精度バイナリ形式で出力します。

  以下の追加設定が必要です。

 

出力のタイミング

OUTCOO

 

前述と同じです。

 

 

 




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