MD計算のための基本設定のうちの一部の設定をおこないます。
計算時間の上限
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CPUTIM
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CPU時間での計算の上限を秒単位で設定します。
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シミュレーションループの上限
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LOOPLI
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MDシミュレーションの最大ループ回数を設定します。
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出力のタイミング
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MONITO
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各エネルギー項、RMSD 、温度、圧力などの標準出力を行うタイミングを設定します。100と設定した場合、100ステップ毎にそのときのエネルギートラジェクトリーが出力されます。
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カットオフの長さ
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CUTLEN
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相互作用のカットオフ長をÅ単位で設定します。
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MD計算