極小化計算のための基本設定をおこないます。
方法 |
METHOD |
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エネルギー極小化の方法を以下から選択します。
最急降下法(Steepest) STEE
共役勾配法(Conjugate) CONJ
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計算時間の上限 |
CPUTIM |
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CPU時間での計算の上限を秒単位で設定します。
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シミュレーションループの上限 |
LOOPLI |
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シミュレーションのループ回数を設定します。
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座標情報の更新サイクル |
UPDATE |
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座標情報の更新サイクルを設定します。 1-5静電相互作用エネルギーにCUTOFF が用いられている場合、相互作用テーブルの更新サイクルになります。また、周期境界条件の場合は、ユニットセルから飛び出した原子の座標をユニットセル内に補正する計算の更新サイクルとなります。
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標準出力の出力サイクル |
MONITO |
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標準出力の出力サイクルエネルギー、RMSDなどの出力を行うサイクルを設定します。
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収束判定条件 |
CONVGR |
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root mean square summation of force (R.M.S.F.) が指定の値より小さい場合、収束したと判定し計算を終了します。単位は(kcal/mol/A)です。
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カットオフの長さ |
CUTLEN |
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相互作用のカットオフ長をÅ単位で設定します。
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