［近接原子の補正］タブではアミノ酸残基中の水素原子が別の残基の原子と1.0Å以内に配置している箇所を検出し、この水素原子と同一残基内で最も近い重原子との距離を半分にする位置にこの水素原子の座標をずらします。
以下、近接原子を補正する手順です。
１．近接原子を含むPDBファイルを読み込みます。
２．［残基編集］ダイアログの［近接原子の補正］タブを表示させ、［更新］ボタンをクリックして末端残基を検索します。
➜ 解析結果リストに該当箇所が列挙されます。
３．リストの［修正］ボタンを押すと該当水素原子をずらします。
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