sievgeneについて
Easy myPresto v3.5には以下のバージョンのsievgeneが収録されています。
sievgene_pack211221, sievgene_for_dockingpose
また、プラットフォーム毎に以下のバイナリを収録しています。
<MFCosgeneインストールディレクトリー> / sievgene / bin |
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sievgene.g60(.exe) |
グリッドポテンシャルのセル数60 |
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sievgene.g100(.exe) |
グリッドポテンシャルのセル数100 |
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sievgene.g120(.exe) |
グリッドポテンシャルのセル数120 |
扱えるデータの制限について
Easy myPrestoに付属しているsievgeneは以下の制限があります。
最大原子数 |
100,000 |
最大分子数(分子の種類) |
100 |
最大分子鎖数 |
60,000 |
最大結合パラメータ |
120,000 |
最大結合角パラメータ |
120,000 |
最大2面角パラメータ |
200,000 |
最大2面角パラメータ(Improper) |
50,000 |
グリッドポテンシャルのセル数(XYZ) |
60, 100, 120 (3つから選択) |
sievgeneバイナリの設定
Easy myPrestoに付属のsievgeneではなく、別途ご用意していただいたsievgeneをご利用することもできます。この場合は使用するsievgeneのパスを指定する必要があります。
手順は以下の通りです。
1.[ファイル]メニュー[オプション(O)…]をクリックします。
➜ [環境設定]ダイアログが表示されます。
2.[myPresto]タブの[ローカルPC]グループの[sievgene:]コンボボックスにローカルPCで利用するsievgeneバイナリをフルパスで入力します。”(bundle)”と入力するとEasy myPrestoに付属のsievgeneが選択されます。